内设管理机构
1. 党政办公室：
负责实验室党政事务的综合管理与协调等工作。
负责人：雷忠 电话：0757-81229090
2. 科研管理与产业化部：
负责实验室科技、产业、国际国内业务合作的归口管理等工作。
负责人：郑灏 电话：0757-81229050
3. 安全与运行保障部：
负责实验室运行、安全、保障、基建的归口管理等工作。设南区办公室，负责南部园区日常管理工作。
负责人：谢启祥 电话：0757-81229076
4. 人力资源部：
负责实验室党组织、人事、人才、研究生的归口管理等工作。
负责人：孟子寒 电话：0757-81229069
5. 纪检室：
负责实验室纪律检查、监督、内部审计等工作。与人事部合署办公。
负责人：孟子寒 电话：0757-81229078
6. 财务与资产管理部：
负责实验室财经工作的归口管理等工作。采购与招投标办公室（挂靠财务部），负责实验室采购与招投标等工作。
负责人：龚林红 (兼)
电话：0757-81229002
内设研发机构
1. 绿氢绿氨制备技术研发中心
2. 燃料电池关键材料与器件研发中心
3. 燃料电池系统与整车技术研发中心
4. 氨氢融合运输装备碳中和技术院士工作站研究院
5. 氨氢新能源工业窑炉零碳燃烧技术研发中心
6. 氢氨安全技术与复合材料研发中心
7. 氢能与燃料电池测试中心
电话：13392766801
8. 能源材料研究与测试中心
电话：0757-63815818
9. 新能源材料轻量化成形技术研发中
